İşte o cinayetlerden bazıları:
Özdemir Sabancı: İş adamı Özdemir Sabancı, 9 Ocak 1996'da DHKP-C militanları Fahriye Erdal, İsmail Akkol ve Mustafa Duyar tarafından öldürülürken, esas katilleri FETÖ tarafından saklandı. Sabancı dosyası, Ergenekon, Hrant Dink ve 17-25 Aralık darbe girişimini organize eden firari savcı Muammer Akkaş tarafından dosya üç yıl boyunca bekletildi.
Cevzet Soysal: 9 Kasım 1998'de kaybolan ve cesedi hâlâ bulunamayan Cevzet Soysal, FETÖ'nün ilk cinayetlerinden. FETÖ'nün Hizbullah mensubu olduğu iddia edilen Cevzet Soysal'ı hedef almasının sebebi, örgütün kumpaslarından Ergenekon operasyonları için yol açmaktı.